安徽省農業科學院是省政府直屬綜合性農業科研事業單位，1960年建院。下設研究機構有水稻、作物、棉花、畜牧、園藝、水產、茶葉、農產品加工等14個專業研究所。建有國家水稻改良分中心、國家茶樹育種分中心、國家棉花育種分中心、國家油菜育種分中心、農業部優勢農作物創新中心、國家長江中下游稻作技術創新中心、農業部轉基因生物產品監督檢測中心等多個工程技術中心，還建有3個省級重點實驗室，為推進科技創新提供條件支撐。
全院現有各類專業技術人員544人，其中具有高級職稱人員238人，學術帶頭人4人，省級學術帶頭人18人，省部級突出貢獻專家12人，5個科研團隊入選省“115產業創新團隊”。在國家現代農業產業技術體系建設中，我院獲得6個科學家崗位、14個綜合實驗站的建設任務，已成為體系中的重要力量。
“十一五”以來，全院共承擔國家“863”高技術計劃、“973”計劃、國家科技支撐計劃等和省級各類項目800多項。獲得國家和省部級科技獎36項，其中國家發明二等獎1項，省部級一等獎2項、二等獎6項；審定農作物新品種83個，制修訂國家及行業標準6項、地方標準68項，獲國家發明專利19項，其中我院研創的“甘藍型油菜隱性上位互作核不育三系選育及制種方法”，榮獲2007年度國家技術發明二等獎。水稻兩系育種、離子束育種、油菜雜交育種、蔬菜育種、基因指紋技術等研究已進入國內先進水平。